De leerling die op zoek is naar meer uitdagingen naast het reguliere onderwijs aanbod, heeft op het Zuyderzee College een grote keuzemogelijkheid.
Hier een opsomming van commissies en verenigingen:

Leerlingenvereniging TEMA organiseert vijf keer per jaar een feestavond in discotheek Rio. Tema wordt gerund door de Tema-crew, zij bestaan uit zo'n 15 jongens en meiden.

Eens per jaar is er een uitwisselingsproject met Japan. Onder de vlag van Vrienden van Japan kunnen enkele leerlingen uit de bovenbouw mee doen aan dit project.

Het Europese Scholieren Parlement is de opstap naar de achte politiek.

Daarnaast heeft het ZC een Culture Crew. Zij houden zich bezig met het organiseren van culturele activiteiten.

De ZC roeiers verzamelen zich in en op het water in één van hun roeisloeps. De vereniging biedt de mogelijkheid om wekelijks te trainen en om af en toe mee te doen aan echte wedstrijden.